70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2365 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2365  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7449  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.45 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5671  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  45.45 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6525  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.45 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6035  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.45 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.32 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.62 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.55 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  38.33 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.13 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.64 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7379  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.53 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000893778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  39.19 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  39.19 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1710  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.86 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443687  normal  0.618525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  39.19 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.29 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  39.19 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  39.19 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5567  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.82 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000568054  normal  0.0551965 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  39.19 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  36.84 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.000000000000292632  decreased coverage  0.0000243295 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.64 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.54 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.24 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000571024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000181219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000220305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000000405362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  35.71 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.64 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.04 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.72 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.72 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6347  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42.62 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000113528  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2981  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207499  decreased coverage  0.0000000417224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.67 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.39 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737815 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6382  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42.62 
 
 		 589 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493779  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.38 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  40 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4935  putative H-NS histon-like DNA-binding protein  40 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.529231  normal  0.833407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.14 
 
 		 191 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  44.26 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000994611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  38.98 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  37.5 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  39.68 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  38.71 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.62 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.68 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  40.35 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000172984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7403  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  33.78 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  42.42 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.35 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.43 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.35 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>