36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2423 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  420  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  59.2 
 
 
202 aa  267  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0083  hypothetical protein  50.78 
 
 
204 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5648  hypothetical protein  45.77 
 
 
205 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0693813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01414  hypothetical protein  48.22 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278321  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0555  hypothetical protein  46.7 
 
 
199 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0912  hypothetical protein  46.91 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.396439  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  47.42 
 
 
200 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6555  hypothetical protein  40.5 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0940504  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  40.8 
 
 
205 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  43.96 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3138  hypothetical protein  40.86 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  37.81 
 
 
205 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  39.7 
 
 
203 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  37.91 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  40.62 
 
 
204 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  40.1 
 
 
203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0786  hypothetical protein  39.27 
 
 
203 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.232716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  39.06 
 
 
203 aa  148  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4243  hypothetical protein  30.93 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3271  hypothetical protein  31.75 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2854  hypothetical protein  29.53 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5577  hypothetical protein  27.32 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3170  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.175438  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1284  abortive infection protein AbiGI  24.61 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4515  hypothetical protein  28.87 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2875  hypothetical protein  27.34 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0679  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0780  hypothetical protein  26.94 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600335  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13950  hypothetical protein  23.12 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1797  hypothetical protein  23.81 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  25.76 
 
 
276 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0556  hypothetical protein  23.26 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000356919 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  26.12 
 
 
276 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0491  hypothetical protein  31.91 
 
 
106 aa  45.1  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.170346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>