152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0559 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0559  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1021    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0535  hypothetical protein  98.57 
 
 
491 aa  1006    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3059  adenosine deaminase  40.83 
 
 
509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.884978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4066  adenosine/AMP deaminase  37.66 
 
 
512 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1233  adenosine/AMP deaminase  35.8 
 
 
531 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.490818  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1678  adenosine/AMP deaminase  37.69 
 
 
483 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3493  adenosine/AMP deaminase  35.24 
 
 
471 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4682  adenosine/AMP deaminase  33.03 
 
 
519 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0478  adenosine/AMP deaminase  27.15 
 
 
566 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2222  adenosine deaminase  26.92 
 
 
537 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  36.03 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  33.33 
 
 
334 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  34.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  34.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  34.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  34.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  34.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  34.69 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  35.25 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  34.69 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  36.03 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  36.76 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  36.76 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  36.76 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  36.76 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  36.03 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  36.03 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  34.01 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  34.01 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  31.13 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  29.74 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  35.29 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  29.19 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  29.19 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  29.19 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  29.88 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  31.98 
 
 
334 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  34.56 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  32.43 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  29.9 
 
 
333 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  32.35 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  33.09 
 
 
331 aa  63.9  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  32.43 
 
 
331 aa  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  23.64 
 
 
322 aa  63.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  29.73 
 
 
332 aa  63.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  31.76 
 
 
331 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  27.08 
 
 
367 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  32.37 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  28.77 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  28.77 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  31.65 
 
 
331 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  31.65 
 
 
331 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  31.85 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  31.65 
 
 
331 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  30.37 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  30.88 
 
 
337 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  31.76 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  26.59 
 
 
337 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  30.88 
 
 
337 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  31.13 
 
 
331 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  23.01 
 
 
366 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  29.2 
 
 
336 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  32.08 
 
 
332 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5107  predicted protein  23.86 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.172841  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  22.68 
 
 
346 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  26.13 
 
 
402 aa  56.6  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  28.57 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  23.36 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  22.59 
 
 
332 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  28.03 
 
 
332 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  27.78 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  33.33 
 
 
342 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  26.09 
 
 
332 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  28.05 
 
 
343 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  27.51 
 
 
360 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  33.08 
 
 
352 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  28.41 
 
 
348 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_3559  predicted protein  27.27 
 
 
351 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0310467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4524  Adenosine deaminase  28.15 
 
 
345 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.437392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  25.93 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  24.55 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  30.5 
 
 
325 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  28.57 
 
 
340 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  24.72 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  21.74 
 
 
364 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  28.47 
 
 
341 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  29.71 
 
 
324 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  26 
 
 
343 aa  50.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  23.56 
 
 
369 aa  50.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  21.92 
 
 
353 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  26.32 
 
 
362 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  24.59 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  25.24 
 
 
381 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  24.59 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  28.79 
 
 
342 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  31.85 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  24.42 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4395  adenosine deaminase  24.26 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  29.63 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  25 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>