272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1250 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  99.72 
 
 
362 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  88.4 
 
 
362 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  100 
 
 
362 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  100 
 
 
362 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  88.4 
 
 
362 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13344  adenosine deaminase  82.87 
 
 
365 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.359069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0976  adenosine deaminase  73.98 
 
 
375 aa  547  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  75.75 
 
 
369 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  69.72 
 
 
359 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  70.56 
 
 
362 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  70.39 
 
 
360 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  70.56 
 
 
364 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  69.47 
 
 
363 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  69.72 
 
 
364 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  69.72 
 
 
364 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  70.03 
 
 
363 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  67.7 
 
 
366 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  69.36 
 
 
373 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  67.99 
 
 
364 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3954  adenosine deaminase  67.22 
 
 
365 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  66.76 
 
 
367 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  63.54 
 
 
367 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  58.89 
 
 
356 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  57.85 
 
 
372 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  55.89 
 
 
367 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  55.12 
 
 
372 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4395  adenosine deaminase  54.97 
 
 
358 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  52.03 
 
 
381 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  54.62 
 
 
371 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  54.65 
 
 
358 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1218  adenosine deaminase  51.45 
 
 
378 aa  338  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000911946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04960  adenosine deaminase  50.66 
 
 
403 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.567283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  53.01 
 
 
360 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  45.05 
 
 
359 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  43.65 
 
 
374 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  43.26 
 
 
376 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  42.94 
 
 
376 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  42.66 
 
 
376 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28230  adenosine deaminase  38.16 
 
 
441 aa  255  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  41.18 
 
 
393 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  32.56 
 
 
332 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  33.43 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  32.27 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  31.62 
 
 
402 aa  180  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  31.64 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  31.23 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  33.81 
 
 
346 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  31.52 
 
 
346 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  33.72 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0538  adenosine deaminase  33.33 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000801372  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  33.43 
 
 
332 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  30.51 
 
 
344 aa  162  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  34.2 
 
 
366 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  31.18 
 
 
333 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  33.04 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  31.96 
 
 
334 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  31.96 
 
 
334 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  34.2 
 
 
331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  31.47 
 
 
333 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  33.91 
 
 
331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  34.2 
 
 
331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  32.46 
 
 
332 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  33.04 
 
 
331 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  33.91 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  33.91 
 
 
331 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  32.47 
 
 
353 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  33.33 
 
 
331 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0791  adenosine deaminase  33.43 
 
 
336 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  33.04 
 
 
331 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  31.27 
 
 
332 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  28.74 
 
 
331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  31.47 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  31.96 
 
 
333 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  29.45 
 
 
333 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  31.4 
 
 
331 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  31.18 
 
 
333 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  31.18 
 
 
333 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  31.67 
 
 
333 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0440  adenosine deaminase  31.64 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  32.66 
 
 
334 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  32.65 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  35.98 
 
 
332 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  30.52 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  29.73 
 
 
337 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  31.45 
 
 
366 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  29.94 
 
 
337 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  26.92 
 
 
333 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  25.53 
 
 
332 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  31.58 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  31.67 
 
 
334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  27.03 
 
 
335 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  31.36 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  30 
 
 
337 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>