31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3412 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3412    100 
 
 		 1704 bp  3378    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  99.16 
 
 		 1077 bp  1376    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  99.03 
 
 		 1047 bp  1368    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  81.19 
 
 		 1017 bp  222  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  78.98 
 
 		 987 bp  155  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  84.21 
 
 		 984 bp  153  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  80.94 
 
 		 984 bp  151  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  83.73 
 
 		 984 bp  145  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  83.73 
 
 		 984 bp  145  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  83.73 
 
 		 984 bp  145  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  83.73 
 
 		 984 bp  145  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  80.66 
 
 		 1017 bp  137  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  83.25 
 
 		 984 bp  137  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  80.63 
 
 		 984 bp  127  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  82.38 
 
 		 984 bp  123  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  82.38 
 
 		 984 bp  123  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  82.38 
 
 		 984 bp  123  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  83.07 
 
 		 984 bp  121  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  80.43 
 
 		 984 bp  121  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  80.46 
 
 		 984 bp  113  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  83.64 
 
 		 984 bp  113  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  79.93 
 
 		 984 bp  111  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  81.34 
 
 		 984 bp  105  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4227  sraC/ryeA RNA, putative  100 
 
 		 254 bp  89.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.287369  normal  0.452166 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  89.83 
 
 		 1017 bp  69.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  90 
 
 		 993 bp  60  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3168    88.68 
 
 		 792 bp  58  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0186296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 1608 bp  50.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 1608 bp  50.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  93.94 
 
 		 1002 bp  50.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 1608 bp  50.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>