18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2982 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2982  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.8595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3057  hypothetical protein  99.29 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3509  hypothetical protein  73.26 
 
 		 286 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3653  hypothetical protein  70.38 
 
 		 285 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.342414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0252  hypothetical protein  45.83 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1310  hypothetical protein  35.76 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0405  hypothetical protein  40.47 
 
 		 211 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00906691  hitchhiker  0.00328119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1200  hypothetical protein  35.19 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.10921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4242  hypothetical protein  46.88 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  31.76 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  39.18 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3317  hypothetical protein  26.34 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0225  hypothetical protein  27.11 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0223  hypothetical protein  27.11 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00452578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2516  hypothetical protein  29.56 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3264  hypothetical protein  26.18 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3902  hypothetical protein  25.22 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400318  normal  0.0196844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1401  hypothetical protein  23.84 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>