22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0824 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0825  virulence determinant  96.59 
 
 		 3110 aa  6033    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0145  putative phage minor structural protein  96.2 
 
 		 3104 aa  6011    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.520123  decreased coverage  0.0000000741368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0824  putative phage minor structural protein  100 
 
 		 3104 aa  6361    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  32.78 
 
 		 2648 aa  133  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  22.29 
 
 		 4798 aa  63.2  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4977  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1151 aa  59.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.122312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  33.08 
 
 		 444 aa  57.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  33.08 
 
 		 444 aa  57  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  33.08 
 
 		 442 aa  57  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.84 
 
 		 2245 aa  53.9  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 1971 aa  53.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  28.48 
 
 		 728 aa  52  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  25.31 
 
 		 813 aa  52  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  34.13 
 
 		 1126 aa  52  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  32.06 
 
 		 476 aa  50.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  26 
 
 		 2954 aa  50.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  38.89 
 
 		 474 aa  49.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.94 
 
 		 3209 aa  49.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  29.17 
 
 		 1286 aa  47.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.11 
 
 		 3598 aa  47  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  50.91 
 
 		 656 aa  46.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 2107 aa  46.2  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>