More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3381 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0907  glycerol kinase  99.79 
 
 		 480 aa  959    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2645  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  70.3 
 
 		 496 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0289536  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3247  carbohydrate kinase  99.6 
 
 		 495 aa  1005    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3381  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 495 aa  1008    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  52.87 
 
 		 491 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3636  carbohydrate kinase FGGY  47.6 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3522  carbohydrate kinase FGGY  47.4 
 
 		 504 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  42.86 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3130  carbohydrate kinase FGGY  45.81 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  42.45 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  40.12 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  41.96 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  42.71 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  40.12 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2031  carbohydrate kinase FGGY  42.42 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0853026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  40.25 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  42.51 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  42.71 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  44.31 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  42.31 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  39.92 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  39.92 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  41.75 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  39.92 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  39.92 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  42.05 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  40.33 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  41.68 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2253  carbohydrate kinase FGGY  42.3 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  42.94 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  41.21 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  41.13 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  41.33 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  40.94 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  41.7 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  39.92 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  39.92 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  40.94 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  41.34 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  40.94 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  38.57 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1657  glycerol kinase  42.32 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  41.13 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  40.85 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  40.94 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  41.13 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  41.33 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  40.93 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  40.77 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  40.68 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  41.33 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  42.69 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  39.84 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  41.68 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  41.33 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  41.33 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  41.41 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  41.08 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  39.84 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  40.73 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  41.55 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  40.73 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  40.57 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  40.08 
 
 		 498 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  41.41 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  41.33 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  40.73 
 
 		 500 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  41.73 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  41.33 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  41.33 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  41.33 
 
 		 503 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  41.33 
 
 		 503 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  41.7 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  43.12 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  40.37 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  42.51 
 
 		 498 aa  363  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  40.53 
 
 		 498 aa  363  4e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  40.32 
 
 		 493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  41.7 
 
 		 499 aa  362  6e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  40.93 
 
 		 500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  40.93 
 
 		 494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  38.79 
 
 		 494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  39.19 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  40.93 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  41.13 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  40.08 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  39.01 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  40.08 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>