23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0825 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0825  virulence determinant  100 
 
 		 3110 aa  6376    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0824  putative phage minor structural protein  96.59 
 
 		 3104 aa  6032    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0145  putative phage minor structural protein  98.42 
 
 		 3104 aa  6261    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.520123  decreased coverage  0.0000000741368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  32.37 
 
 		 2648 aa  130  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  21.99 
 
 		 4798 aa  59.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4977  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1151 aa  59.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.122312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  33.08 
 
 		 444 aa  57  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  33.08 
 
 		 444 aa  57.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  33.08 
 
 		 442 aa  57  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  26.93 
 
 		 813 aa  56.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.74 
 
 		 2245 aa  54.3  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 1971 aa  53.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  33.79 
 
 		 476 aa  50.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  27.88 
 
 		 728 aa  50.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  32.54 
 
 		 1126 aa  49.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  30.1 
 
 		 474 aa  49.7  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  33.94 
 
 		 3209 aa  49.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  26 
 
 		 2954 aa  48.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.57 
 
 		 3598 aa  47.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  30.25 
 
 		 1286 aa  47.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.25 
 
 		 980 aa  47  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  50.91 
 
 		 656 aa  46.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  28.42 
 
 		 946 aa  46.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>