218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0418 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0418  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 233 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0350  putative deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 233 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  37.16 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  34.98 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5350  deoxyribose-phosphate aldolase  33.93 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  34.58 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  37.79 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  38.74 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  36.53 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  36.28 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  34.39 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  35.86 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  36.28 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  36.28 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0134  deoxyribose-phosphate aldolase  34.76 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  35.81 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  36.57 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  33.95 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  35.81 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  35.81 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  35.81 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  35.81 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  35.81 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  35.16 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  34.8 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  33.95 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  34.42 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  35.11 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  32.38 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  32.88 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  33.48 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  35.02 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  34.26 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  33.94 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  31.8 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  34.42 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  35.38 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  34.88 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  32.16 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  33.78 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0544  deoxyribose-phosphate aldolase  35.16 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  33.64 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  33.81 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  33.04 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  33.48 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  33.49 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  32.86 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  35.45 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  35.45 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  33.33 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  33.33 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  32.13 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  35.4 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  34.57 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  33.03 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  33.03 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  34.21 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl639  deoxyribose-phosphate aldolase  31.68 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  34.07 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  29.78 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  34.57 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  30.28 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  33.16 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  35.94 
 
 		 409 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  33.16 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  34.85 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  34.48 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3719  deoxyribose-phosphate aldolase  30.59 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.485084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  33.8 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  32.65 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  32.74 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  30.36 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  34.41 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  34.41 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4603  deoxyribose-phosphate aldolase  31.61 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  32.06 
 
 		 317 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  27.31 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  31.98 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0763  deoxyribose-phosphate aldolase  28.95 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.503498  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3002  deoxyribose-phosphate aldolase  33.17 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  31.63 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  33.64 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  30.77 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0114  deoxyribose-phosphate aldolase  29.82 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  33.33 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  28.37 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  34.15 
 
 		 269 aa  85.1  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  28.7 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  31.55 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  31.53 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  31.02 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1388  deoxyribose-phosphate aldolase  36.41 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  28.51 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2469  deoxyribose-phosphate aldolase  29.11 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.271391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1524  deoxyribose-phosphate aldolase  36.16 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0572  deoxyribose-phosphate aldolase  33.03 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.574105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  31.38 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2974  deoxyribose-phosphate aldolase  24.78 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0983  deoxyribose-phosphate aldolase  26.55 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231215  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  27.91 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>