More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1968 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  100 
 
 		 619 aa  1212    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  49.91 
 
 		 616 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5093  ABC transporter related protein  50.59 
 
 		 597 aa  525  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.390204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  49.75 
 
 		 608 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  45.56 
 
 		 637 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  47.11 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 620 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  39.97 
 
 		 578 aa  349  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  39.24 
 
 		 575 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  40.03 
 
 		 590 aa  333  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  40.75 
 
 		 595 aa  319  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.65 
 
 		 626 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  33.83 
 
 		 653 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 606 aa  270  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  36.27 
 
 		 683 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3667  ABC transporter related  35.36 
 
 		 617 aa  266  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.18 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.65 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.18 
 
 		 586 aa  253  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.65 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  30.69 
 
 		 573 aa  251  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.56 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  29.47 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.47 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 586 aa  248  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.76 
 
 		 607 aa  246  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  29.93 
 
 		 583 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.44 
 
 		 631 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.43 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.56 
 
 		 644 aa  236  8e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.56 
 
 		 597 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.85 
 
 		 575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.81 
 
 		 575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28.4 
 
 		 640 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  28.74 
 
 		 613 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  31.36 
 
 		 606 aa  233  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  27.85 
 
 		 579 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.27 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  27.06 
 
 		 619 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.27 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  29.98 
 
 		 627 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.92 
 
 		 637 aa  231  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.18 
 
 		 614 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  27.77 
 
 		 628 aa  231  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 598 aa  230  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.59 
 
 		 625 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  27.14 
 
 		 636 aa  228  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.81 
 
 		 587 aa  228  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.78 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  27.13 
 
 		 614 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.03 
 
 		 615 aa  227  5.0000000000000005e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.23 
 
 		 608 aa  227  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.71 
 
 		 637 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.64 
 
 		 587 aa  226  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.87 
 
 		 598 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  29.14 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.27 
 
 		 572 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  27.4 
 
 		 575 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  27.4 
 
 		 575 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.84 
 
 		 669 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.14 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.05 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.78 
 
 		 677 aa  224  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.09 
 
 		 575 aa  224  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  26.68 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  31.7 
 
 		 811 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.33 
 
 		 600 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.4 
 
 		 672 aa  223  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.39 
 
 		 592 aa  223  8e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.98 
 
 		 587 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.88 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.89 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.61 
 
 		 666 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.35 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.35 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.26 
 
 		 600 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.35 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.35 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.38 
 
 		 620 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  26.69 
 
 		 607 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.63 
 
 		 590 aa  221  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.91 
 
 		 567 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.17 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.01 
 
 		 571 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.22 
 
 		 606 aa  220  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.09 
 
 		 595 aa  220  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  29.15 
 
 		 602 aa  220  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  29.79 
 
 		 814 aa  220  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.26 
 
 		 600 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.86 
 
 		 613 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.97 
 
 		 628 aa  220  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.05 
 
 		 644 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.88 
 
 		 572 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.05 
 
 		 644 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  29.79 
 
 		 768 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.08 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  28.84 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.88 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>