35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2011 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  64.89 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  62.58 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  62.04 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1505  Rubrerythrin  64.58 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  64.58 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  62.04 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0196  hypothetical protein  61.99 
 
 		 327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.057025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4264  Rubrerythrin  61.85 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4072  rubrerythrin  62.89 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4529  Rubrerythrin  61.23 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0107  ferritin-like protein  62.66 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0850  hypothetical protein  63.99 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155154  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2509  rubrerythrin  63.99 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  60.56 
 
 		 327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  54.97 
 
 		 323 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  56.88 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  55.94 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  56.56 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  52.37 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  54.66 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3115  Rubrerythrin  53.94 
 
 		 319 aa  325  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  51.52 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3624  rubrerythrin  50.79 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457724  normal  0.52247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  52.48 
 
 		 323 aa  305  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2267  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.71 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  52.7 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0180  hypothetical protein  69.54 
 
 		 267 aa  236  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0891  hypothetical protein  61.05 
 
 		 178 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0271275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2719  protein of unknown function DUF125 transmembrane  61.44 
 
 		 175 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1435  hypothetical protein  50.91 
 
 		 172 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2546  hypothetical protein  60.26 
 
 		 174 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0875  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.56 
 
 		 163 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>