More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3295 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3295  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
374 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4825  putative alcohol dehydrogenase  57.75 
 
 
375 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0410996  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.69 
 
 
375 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.14 
 
 
377 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2747  alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 
403 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2610  alcohol dehydrogenase  55.73 
 
 
375 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721019 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.47 
 
 
375 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0344  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.47 
 
 
375 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.422853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0183  alcohol dehydrogenase  54.84 
 
 
376 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3061  alcohol dehydrogenase  54.3 
 
 
374 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0472  alcohol dehydrogenase  54.84 
 
 
374 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1824  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  54.84 
 
 
374 aa  358  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5014  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.14 
 
 
366 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3448  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.21 
 
 
371 aa  299  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.51 
 
 
368 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0111  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.79 
 
 
370 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.595465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0101  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 
370 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0961812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0120  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 
370 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0192727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3947  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.42 
 
 
372 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.607291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1320  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07750  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  46.49 
 
 
383 aa  272  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.969259  normal  0.331312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2496  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.45 
 
 
374 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4357  putative alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
378 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  37.6 
 
 
384 aa  255  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0817  alcohol dehydrogenase, class III  37.33 
 
 
376 aa  255  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10163  zinc-type alcohol dehydrogenase subunit E adhE  43.32 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.78 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
376 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  43.01 
 
 
361 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1438  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
374 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1939  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
374 aa  248  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1671  Zn-dependent alcohol dehydrogenase class III  36.78 
 
 
376 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610289  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.24 
 
 
376 aa  245  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1616  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  36.24 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0459  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.79 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1125  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.34 
 
 
370 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.24 
 
 
376 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1170  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
370 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583443  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
373 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2054  alcohol dehydrogenase class III  35.69 
 
 
379 aa  242  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4161  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.07 
 
 
370 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.983661  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
373 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.98 
 
 
361 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0608  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
370 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0161  zinc-binding dehydrogenase  35.83 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  37 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4059  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
370 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
361 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  35.97 
 
 
375 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  35.15 
 
 
379 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
379 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
379 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
379 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
379 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1558  alcohol dehydrogenase, class III  36.07 
 
 
370 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.86343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
376 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
376 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0069  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  35.87 
 
 
368 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.25 
 
 
370 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
385 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
379 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
379 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
379 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  36.34 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2311  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
373 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
372 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  35.79 
 
 
376 aa  235  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4784  alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00530396  normal  0.688561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0321  alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1367  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.79 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17400  alcohol dehydrogenase class III  36.07 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3587  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
369 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.33 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.79 
 
 
382 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1510  class III alcohol dehydrogenase  35.79 
 
 
370 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.23 
 
 
374 aa  232  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3334  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
364 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3253  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
368 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
376 aa  232  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3418  alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
369 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128659  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2527  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
369 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0605767  normal  0.410127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 
360 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  34.79 
 
 
382 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0605  bifunctional: glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase/alcohol dehydrogenase class III  35.05 
 
 
368 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.25 
 
 
369 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  34.52 
 
 
382 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4639  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
369 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0522  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
368 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2495  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
369 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0713  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase(FlhA)  34.51 
 
 
368 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.009216  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3427  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
376 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>