More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1897 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 538 aa  1073    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  61.82 
 
 		 538 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  61.22 
 
 		 551 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.69 
 
 		 538 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  62.76 
 
 		 538 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  63.22 
 
 		 538 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  61.64 
 
 		 540 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  62.89 
 
 		 539 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.69 
 
 		 538 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.69 
 
 		 538 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  65.36 
 
 		 536 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  61.22 
 
 		 540 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  61.26 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  59.48 
 
 		 539 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  59.48 
 
 		 539 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  58.81 
 
 		 537 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  55.15 
 
 		 553 aa  554  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  54.56 
 
 		 536 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  51.34 
 
 		 538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  51.79 
 
 		 538 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  52 
 
 		 538 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  51.53 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 538 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.29 
 
 		 527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  48.98 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  48.52 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.03 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  47.66 
 
 		 530 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  47.9 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  47.46 
 
 		 530 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  47.21 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  47.46 
 
 		 530 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  47.97 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.41 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  44.36 
 
 		 532 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  46.07 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  44.76 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.57 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  45.42 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  44.94 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  46.25 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.24 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  47.52 
 
 		 540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.1 
 
 		 542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 546 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  45.22 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  44.51 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  44.42 
 
 		 536 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4552  propionyl-CoA carboxylase  44.95 
 
 		 534 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  42.39 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  45.76 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1712  Propionyl-CoA carboxylase  48.26 
 
 		 531 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.284858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  46.2 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  45.86 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  44.69 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  45.54 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  46.83 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  44.4 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  45.19 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  45.36 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  44.57 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  46.9 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  42.54 
 
 		 554 aa  435  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  44.22 
 
 		 535 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  44.32 
 
 		 536 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  44.22 
 
 		 535 aa  432  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  43.75 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  42.17 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  45.05 
 
 		 536 aa  432  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  45.36 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  44.3 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  44.4 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  44.59 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  44.59 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  43.85 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  44.06 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  44.49 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  42.57 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  42.86 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  44.3 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  43.57 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  45.84 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  43.14 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  43.15 
 
 		 537 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  43.04 
 
 		 535 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.72 
 
 		 535 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  44.85 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  45.32 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  45.78 
 
 		 533 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  46.68 
 
 		 552 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  43.59 
 
 		 535 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>