30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1887 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  223  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  48.24 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  46.74 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  43.33 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  32.94 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  34.12 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  31.11 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  33.72 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  34.12 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  28.24 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  28.24 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  32.14 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  33.73 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  37.8 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  29.55 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  29.63 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  30.34 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  30.68 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  27.4 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  32.1 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  31.25 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  31.17 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  31.11 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  42.86 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  30 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>