58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4660 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  100 
 
 		 449 aa  884    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  53.43 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  48.48 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  49.64 
 
 		 451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  51.15 
 
 		 449 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  51.95 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  44.52 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  48.36 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  42.51 
 
 		 464 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  43.23 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  43.2 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  41.87 
 
 		 471 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  41.87 
 
 		 471 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  43.68 
 
 		 467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  39.04 
 
 		 428 aa  269  8e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  38.92 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  39.01 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  39.01 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  43.44 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  39.43 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  37.27 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  37.33 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  37.1 
 
 		 430 aa  233  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  36.73 
 
 		 430 aa  232  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  36.72 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  37.41 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  36.28 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  36.28 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  37.41 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.56 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  53.12 
 
 		 132 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  32.73 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.29 
 
 		 217 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.49 
 
 		 242 aa  54.7  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.11 
 
 		 235 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  31.58 
 
 		 552 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.17 
 
 		 217 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.51 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  30.06 
 
 		 206 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.08 
 
 		 202 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  27.86 
 
 		 215 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  25.94 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  29.5 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  29.95 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  29.38 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  29.35 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  27.36 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.52 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  32.67 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  29.32 
 
 		 563 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  27.36 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  26.88 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  27.36 
 
 		 215 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  27.36 
 
 		 215 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  29.32 
 
 		 568 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.32 
 
 		 563 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  29.32 
 
 		 563 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1372  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.21 
 
 		 240 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>