32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3625 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1081    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  47.75 
 
 		 586 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  46.29 
 
 		 550 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  30.23 
 
 		 555 aa  243  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  28.18 
 
 		 551 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  27.8 
 
 		 551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  28.45 
 
 		 547 aa  133  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  29.8 
 
 		 552 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  26.51 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  28.33 
 
 		 551 aa  127  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  26.01 
 
 		 550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  27.55 
 
 		 545 aa  120  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  25.6 
 
 		 558 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  25.29 
 
 		 552 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  23.93 
 
 		 545 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  24.31 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  25.94 
 
 		 509 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  27.1 
 
 		 548 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  28.15 
 
 		 553 aa  93.2  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  25.77 
 
 		 624 aa  90.5  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  29.07 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  25.1 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  24.37 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  24.37 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  43.59 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  27.36 
 
 		 536 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  23.15 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5443  hypothetical protein  26.15 
 
 		 661 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  23.99 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  26.99 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  32.84 
 
 		 649 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  25.87 
 
 		 578 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>