13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2968 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  38.54 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  33.8 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  43.58 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.5 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.97 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.06 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  30.24 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  35.11 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  29.95 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>