18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1633 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1633  putative signal peptide protein  100 
 
 		 168 aa  337  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2980  putative signal peptide protein  65.85 
 
 		 180 aa  200  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1443  putative signal peptide protein  56.8 
 
 		 172 aa  190  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1190  putative signal peptide protein  53.7 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.672558  normal  0.403432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1110  putative signal peptide protein  53.37 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3153  putative signal peptide protein  52.12 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1808  putative signal peptide protein  57.62 
 
 		 170 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000025679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2779  putative signal peptide protein  52.6 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881976  normal  0.0394345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5001  putative signal peptide protein  48.03 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2061  putative signal peptide protein  46.2 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00788966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1259  putative signal peptide protein  45.22 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.617391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2075  putative signal peptide protein  46.63 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1087  conserved hypothetical signal peptide protein  46.45 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1180  putative signal peptide protein  46.45 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2056  putative signal peptide protein  48.78 
 
 		 188 aa  98.2  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3582  putative signal peptide protein  44.52 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3649  hypothetical protein  32.65 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3762  hypothetical protein  35.23 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.118214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>