14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0805 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0805  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  95.05 
 
 		 1107 aa  401  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0018  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1020 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.52 
 
 		 11716 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.78 
 
 		 6678 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 		 1735 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1916 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1265 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.21 
 
 		 306 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 1112 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  21.71 
 
 		 4761 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1859  protein of unknown function DUF1680  29.29 
 
 		 736 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  23.47 
 
 		 686 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  25.5 
 
 		 747 aa  41.2  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>