More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3010 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  100 
 
 		 207 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  68.14 
 
 		 207 aa  290  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  32.88 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  29.56 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  32.52 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  26.79 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  30.95 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  25.36 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  32.32 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  33.49 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.51 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  31.75 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  31.98 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  29.56 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  27.14 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  27.62 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  33.51 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  29.81 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  26.67 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  25.84 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  25.84 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  29.8 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  29.13 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  27.52 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.55 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  34.75 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  26.03 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  27.86 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  26.76 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  28.5 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  31.94 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  31.61 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  26.54 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  27 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  25.37 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  30.89 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  27.18 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  29.52 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  26.92 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  25.81 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  26.92 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  26.67 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  26.44 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  26.44 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  26.44 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  31.03 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  26.44 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  26.44 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  26.19 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  30.48 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  24.53 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  26.98 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  26.44 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  28.85 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  25.7 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  23.61 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  31.94 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.02 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  24.53 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  25.6 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  26.96 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  27.4 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  25.73 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  24.88 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  25 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  24.07 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  27.62 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  28.17 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  25.33 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  24.65 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  24.77 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  23.44 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  35 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  28.69 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  24.4 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  26.96 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  26.9 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  29.86 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  22.33 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  27.32 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  28.67 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  25.49 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  29.27 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  25.24 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  22.93 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  24.4 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  23.79 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  27.44 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  25.39 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  27.5 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1182  acetyltransferase, putative  30 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.142998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  26.17 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  26.92 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2311  hexapaptide repeat-containing transferase  24.76 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0450903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  26.17 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  22.83 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  25.84 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  22.17 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2251  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  32.77 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.916384  hitchhiker  0.00856582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>