25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06635 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06635  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 
271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3377  hypothetical protein  53.68 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2784  hypothetical protein  49.82 
 
 
293 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215341  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2215  hypothetical protein  50.19 
 
 
291 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.344292  normal  0.54623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2291  hypothetical protein  49.63 
 
 
291 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0547683  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2379  hypothetical protein  49.07 
 
 
295 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00093197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1819  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  49.07 
 
 
290 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0201346  normal  0.303946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2647  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  49.07 
 
 
290 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.799377  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2424  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  49.25 
 
 
291 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2525  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  49.07 
 
 
290 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.4236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2532  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  49.07 
 
 
290 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2286  hypothetical protein  47.23 
 
 
293 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00446076  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2179  hypothetical protein  48.16 
 
 
291 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1811  hypothetical protein  47.6 
 
 
293 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1559  hypothetical protein  48.12 
 
 
294 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1473  hypothetical protein  49.07 
 
 
294 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00308505  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1766  hypothetical protein  50.36 
 
 
291 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.409768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1574  hypothetical protein  48.34 
 
 
290 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01912  hypothetical protein  48.89 
 
 
281 aa  254  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2614  hypothetical protein  47.79 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2266  hypothetical protein  45.22 
 
 
289 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1890  hypothetical protein  42.49 
 
 
293 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00413299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1196  hypothetical protein  37.92 
 
 
278 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2430  hypothetical protein  36.96 
 
 
293 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100879  normal  0.098268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2040  hypothetical protein  34.07 
 
 
289 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>