42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06478 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06478  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000615  lipoate-protein ligase A  81.62 
 
 		 236 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.262115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1694  hypothetical protein  58.44 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.27085  normal  0.345347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0257  hypothetical protein  58.15 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3049  hypothetical protein  31.37 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4853  hypothetical protein  33.17 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0595  hypothetical protein  31.39 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55710  hypothetical protein  32.16 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4578  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0453  hypothetical protein  30.36 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671995  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4780  hypothetical protein  30.36 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0456  hypothetical protein  29.73 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0423  hypothetical protein  30.63 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5112  hypothetical protein  29.86 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1599  lipoate-protein ligase A-like protein  34.55 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2266  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.82 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5934  lipoate-protein ligase A domain-containing protein  30.19 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5553  hypothetical protein  27.84 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.160541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3471  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.86 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3363  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.11 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3907  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.75 
 
 		 281 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5515  lipoate-protein ligase A, putative  28.67 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0225  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.05 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.562089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.67 
 
 		 331 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5442  putative lipoate-protein ligase A  28.19 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5635  lipoate-protein ligase A  26.53 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5084  lipoate-protein ligase A  26.53 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5479  putative lipoate-protein ligase A  26.53 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5067  lipoate-protein ligase A  26.53 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5237  lipoate-protein ligase A  26.53 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0612  lipoate-protein ligase A-like protein  22.93 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5509  putative lipoate-protein ligase A  26.53 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0627  lipoate-protein ligase A protein  22.93 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5565  putative lipoate-protein ligase A  25.85 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5179  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.25 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0237  lipoate-protein ligase A family protein  24.85 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  26.85 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.31 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0105  putative lipoate-protein ligase A  21.43 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1062  hypothetical protein  27.55 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2051  hypothetical protein  24.31 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>