33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004333 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  100 
 
 		 1199 aa  2454    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  27.62 
 
 		 479 aa  77  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  26.09 
 
 		 476 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.15 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  28.1 
 
 		 541 aa  64.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  29.24 
 
 		 474 aa  64.3  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  27.34 
 
 		 746 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  25.96 
 
 		 442 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  25.64 
 
 		 477 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  25.1 
 
 		 441 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  29.63 
 
 		 480 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  29.63 
 
 		 511 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25.51 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  23.72 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  26.42 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  27.6 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  23.92 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  25.53 
 
 		 294 aa  57.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  21.27 
 
 		 484 aa  57.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  25.86 
 
 		 482 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  26.74 
 
 		 325 aa  56.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  23.21 
 
 		 377 aa  56.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  25.23 
 
 		 358 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  27.57 
 
 		 511 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.4 
 
 		 272 aa  55.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.98 
 
 		 951 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  21.18 
 
 		 534 aa  53.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.83 
 
 		 286 aa  52.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  24.6 
 
 		 480 aa  51.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  26.92 
 
 		 516 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  26.12 
 
 		 603 aa  46.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  26.12 
 
 		 603 aa  46.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 1036 aa  45.8  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>