24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003499 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003499  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  323  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02272  hypothetical protein  87.01 
 
 		 150 aa  282  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1125  hypothetical protein  59.72 
 
 		 158 aa  180  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  46.71 
 
 		 335 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1910  hypothetical protein  46.22 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4818  hypothetical protein  41.45 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4142  hypothetical protein  39.44 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4426  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0342  hypothetical protein  39.31 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0054  hypothetical protein  38.73 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4131  hypothetical protein  37.93 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4101  hypothetical protein  37.93 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4219  hypothetical protein  37.93 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292897  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0238  hypothetical protein  37.93 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3618  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4504  hypothetical protein  40.29 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3911  hypothetical protein  39.57 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3786  hypothetical protein  39.57 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.628281  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3715  hypothetical protein  39.57 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.784158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0052  hypothetical protein  37.06 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0397  hypothetical protein  30.34 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3266  hypothetical protein  28.71 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3122  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0516207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3714  hypothetical protein  27.93 
 
 		 155 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>