52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001493 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  700    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  24.35 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  23.03 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  23.48 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  22.97 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  23.4 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  22.03 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.4 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  26.78 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  25.64 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  24.83 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  26.95 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  20.65 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  25.95 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  25.12 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  24.78 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  21.48 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  23.37 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  23.05 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  22.71 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  22.13 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.98 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  23.75 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  22.95 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  23.1 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.18 
 
 		 505 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  22.54 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  22.54 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.27 
 
 		 568 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  24.55 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  23.23 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  20.73 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.31 
 
 		 546 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  21.07 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  21.35 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  21.31 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  21.93 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  25.65 
 
 		 498 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  21.89 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  27.87 
 
 		 498 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  29.66 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  26.79 
 
 		 568 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  23.53 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  21.85 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  22.17 
 
 		 551 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  23.32 
 
 		 545 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  25.52 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.85 
 
 		 607 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  23.03 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  22.96 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.41 
 
 		 633 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.59 
 
 		 633 aa  42.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>