More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0443 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  34.46 
 
 
195 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1882  serine O-acetyltransferase  37.93 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  0.794876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  34.83 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  42.61 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  32.07 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  32.87 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.67 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.56 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3564  serine acetyltransferase  33.14 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.63814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3570  Serine acetyltransferase-like protein  31.07 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220057  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  34.97 
 
 
242 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  43.56 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  31.11 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 
273 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  32.21 
 
 
240 aa  77.8  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 
273 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 
273 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  33.11 
 
 
273 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  35.71 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  31.11 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  32.41 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  30.46 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  32.41 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  31.69 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  32.45 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1357  satase isoform II  32.56 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  31.17 
 
 
273 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.95 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  35.16 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  30.07 
 
 
539 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  33.88 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2097  serine O-acetyltransferase  29.93 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  33.87 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.74 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  29.03 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0385  hypothetical protein  32.68 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  31.82 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4978  serine O-acetyltransferase (serine acetyltransferase)  34.06 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0409  hypothetical protein  32.68 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  29.8 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
245 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  31.71 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  30.28 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  29.22 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  33.6 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.423159 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  34.31 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  29.17 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  33.6 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  33.6 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  33.6 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  32.48 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  33.6 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  30.07 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  29.55 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0128  serine acetyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25771  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2073  serine O-acetyltransferase  31.94 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.103655  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  27.97 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  35.2 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  31.16 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  29.17 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3216  serine O-acetyltransferase  36.61 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  24.87 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  30.43 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0896  serine O-acetyltransferase  30.68 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0394275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1845  serine acetyltransferase-like protein  36.21 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  29.22 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  36.61 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  31.13 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  38.38 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3267  serine O-acetyltransferase  36.61 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18291  Serine acetyltransferase  33.09 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.095419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  31.17 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  32.58 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54880  putative serine acetyltransferase  32.87 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000008722  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  31.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  30.28 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  38.24 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  29.1 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  31.78 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4533  serine acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.191412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  34.19 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.14 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>