32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1041 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1041  phage tail tape measure family protein  100 
 
 		 605 aa  1220    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1041  probable tail length determinator  43.31 
 
 		 704 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1298  TP901 family phage tail tape measure protein  45.23 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0736  TP901 family phage tail tape measure protein  45.54 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.670611  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05040  hypothetical protein  43.88 
 
 		 851 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0709  TP901 family phage tail tape measure protein  39.47 
 
 		 709 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  43.6 
 
 		 598 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  43.4 
 
 		 598 aa  350  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5067  putative tail tape measure protein  35.89 
 
 		 684 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0689  putative tail tape measure protein  35.89 
 
 		 684 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0910  TP901 family phage tail tape measure protein  28.19 
 
 		 658 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0253  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.16 
 
 		 617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0574  TP901 family phage tail tape measure protein  29.02 
 
 		 731 aa  210  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0262287  normal  0.426184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2922  hypothetical protein  27.33 
 
 		 656 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0826266  hitchhiker  0.0000000000000799042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3478  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  28.71 
 
 		 656 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000755136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2787  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region  25.72 
 
 		 655 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.53 
 
 		 760 aa  140  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  31.53 
 
 		 1211 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.97 
 
 		 1211 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  30.41 
 
 		 1211 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1496  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  0.205956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.39 
 
 		 733 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  25.23 
 
 		 1216 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.62 
 
 		 981 aa  54.3  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.33 
 
 		 1173 aa  54.3  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  25.75 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  25.75 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  25.96 
 
 		 629 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1640  M23/M37 peptidase domain-containing protein  24.55 
 
 		 2757 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  25.29 
 
 		 1297 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  30.2 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  33.05 
 
 		 1030 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>