More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1455 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1455  Ribonuclease H  100 
 
 		 159 aa  332  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  53.38 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  53.85 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  53.15 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  53.15 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  53.15 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  53.15 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  53.15 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  53.15 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  52.45 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  51.7 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  52.11 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  53.15 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  52.86 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  52.86 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  52.86 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  50.34 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  51.8 
 
 		 155 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  51.37 
 
 		 152 aa  153  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  51.08 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  52.86 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  54.35 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  55.97 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  50.7 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  52.38 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  53.19 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  52.17 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  52.86 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  52.14 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  52.14 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  51.7 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  50.69 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  52.78 
 
 		 148 aa  150  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  50.7 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4730  ribonuclease H  52.86 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4350  ribonuclease H  52.86 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4436  ribonuclease H  52.86 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  49.29 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  51.01 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  49.29 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  49.03 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  50 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  51.75 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  52.63 
 
 		 228 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  51.77 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  53.28 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  52.63 
 
 		 228 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  51.03 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  49.64 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  51.09 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  51.72 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  50.35 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  50.35 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1836  ribonuclease H  52.86 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  51.77 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  51.43 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  53.68 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  52.94 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  52.94 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  51.39 
 
 		 148 aa  147  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  49.65 
 
 		 147 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  51.11 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  49.3 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  50.36 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  49.3 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  51.47 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  51.39 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  48.57 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  50.68 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  53.62 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  49.32 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  48.03 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  51.43 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  48.98 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  51.02 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  51.11 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  50.35 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  50 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  48.98 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  51.43 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  50.38 
 
 		 225 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  51.43 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  50.72 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  50 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  47.89 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  48.28 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  49.3 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  52.21 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  52.94 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  49.64 
 
 		 223 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  50.36 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4905  ribonuclease H  51.43 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>