More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1274 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  100 
 
 		 118 aa  233  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 		 116 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 116 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  164  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 115 aa  159  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  71.43 
 
 		 114 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 		 114 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 116 aa  156  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 115 aa  154  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 113 aa  153  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  67.57 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 113 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 113 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 113 aa  146  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2561  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000880835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2781  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 116 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  63.39 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  60.91 
 
 		 113 aa  144  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 113 aa  141  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  59.82 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 116 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  58.56 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  59.62 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  56.9 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 118 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 115 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  58.77 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  133  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  56.14 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>