25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0286 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  100 
 
 
488 aa  985    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  39.25 
 
 
979 aa  299  9e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  26.27 
 
 
1157 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  30.18 
 
 
766 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  25.76 
 
 
429 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  27.01 
 
 
1065 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  25.81 
 
 
1224 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  26.23 
 
 
914 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  23.37 
 
 
1011 aa  94  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  26.37 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  25.08 
 
 
641 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  25.09 
 
 
640 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  29.58 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  24.48 
 
 
748 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  28.11 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  36.11 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  25.19 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  26.92 
 
 
802 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  24.43 
 
 
624 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  24.36 
 
 
630 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  27.35 
 
 
679 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  24.86 
 
 
431 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  21.5 
 
 
904 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  23.45 
 
 
522 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  25.43 
 
 
522 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>