16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0349 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  828    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  26.03 
 
 		 1157 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  36.11 
 
 		 488 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  25.53 
 
 		 766 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  36.54 
 
 		 979 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  23.83 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  22.25 
 
 		 641 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  24.58 
 
 		 522 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  24.58 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  23.6 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  24.7 
 
 		 914 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  35.82 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  23.02 
 
 		 1065 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  22.97 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  29.27 
 
 		 679 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  41.18 
 
 		 624 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>