26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1281 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  100 
 
 		 657 aa  1272    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  36.33 
 
 		 641 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  33.74 
 
 		 1065 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  29.35 
 
 		 914 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  33.67 
 
 		 1011 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  30.22 
 
 		 748 aa  157  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  28.12 
 
 		 1157 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  29.82 
 
 		 640 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  27.81 
 
 		 630 aa  111  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  26.86 
 
 		 623 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  32.37 
 
 		 624 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  30.08 
 
 		 802 aa  101  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  28.07 
 
 		 766 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  25.32 
 
 		 979 aa  89  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  24.83 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  24.32 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  24.32 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  32 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  29.27 
 
 		 679 aa  77.8  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  26.05 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  29.58 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  23.76 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  26.64 
 
 		 1224 aa  67.4  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  22.51 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  26.11 
 
 		 904 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4292  hypothetical protein  30.61 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927933  normal  0.0728263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>