23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2076 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1285    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  32.74 
 
 
640 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  28.22 
 
 
630 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  30.64 
 
 
359 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  27.5 
 
 
679 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  29.16 
 
 
802 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  26.86 
 
 
657 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  31.39 
 
 
624 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  27.67 
 
 
766 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  26.92 
 
 
748 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  26.05 
 
 
1011 aa  87.4  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  25.62 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  25.56 
 
 
914 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  25.44 
 
 
1157 aa  80.9  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
1065 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  28.95 
 
 
979 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  25.19 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  28.67 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  24.39 
 
 
431 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  23.67 
 
 
1224 aa  58.5  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  22.37 
 
 
522 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  22.45 
 
 
522 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  27.62 
 
 
310 aa  51.2  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>