21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1868 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  888    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  27.16 
 
 		 1011 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  26.21 
 
 		 914 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  25.74 
 
 		 1065 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  25.76 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  25.29 
 
 		 748 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  25.86 
 
 		 1157 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  26.17 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  25.83 
 
 		 766 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  26.05 
 
 		 657 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.76 
 
 		 1224 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  27.94 
 
 		 979 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  24.39 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  24.22 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  23.31 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  24.86 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  25.21 
 
 		 522 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  36.23 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  30.23 
 
 		 630 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  29.29 
 
 		 624 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  22.97 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>