27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5817 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  100 
 
 
641 aa  1267    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  35.85 
 
 
657 aa  292  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  33.82 
 
 
1011 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  34.46 
 
 
914 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
1065 aa  194  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  31.44 
 
 
748 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  31.99 
 
 
802 aa  156  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  28.57 
 
 
1157 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  32.35 
 
 
624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  32.19 
 
 
630 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  28.61 
 
 
766 aa  125  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  31.94 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  39.68 
 
 
429 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  28.2 
 
 
1224 aa  98.6  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  28.57 
 
 
679 aa  95.5  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  27.51 
 
 
359 aa  89  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  27.5 
 
 
310 aa  84  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  25.62 
 
 
623 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  24.35 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  23.13 
 
 
979 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  24.82 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  25.08 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  26.17 
 
 
431 aa  77  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  27.72 
 
 
904 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  22.25 
 
 
399 aa  53.9  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  23.7 
 
 
406 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4292  hypothetical protein  20.93 
 
 
456 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927933  normal  0.0728263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>