26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1209 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  872    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  28.74 
 
 		 766 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  30.77 
 
 		 641 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  30.05 
 
 		 1065 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  27.95 
 
 		 1157 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  27.31 
 
 		 748 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  26.7 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  24.65 
 
 		 979 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  40.68 
 
 		 1011 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  41.18 
 
 		 914 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  25.76 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  32 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  29.06 
 
 		 679 aa  80.5  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  26.42 
 
 		 802 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  29.96 
 
 		 624 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  38.21 
 
 		 1224 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  24.89 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  28.76 
 
 		 640 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  24.03 
 
 		 623 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  23.23 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  25.78 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  22.6 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4292  hypothetical protein  22.93 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927933  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  24.07 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  21.05 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  26.61 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>