27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4453 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1257    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  34.66 
 
 		 641 aa  144  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  29.58 
 
 		 802 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  31.27 
 
 		 748 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  31.16 
 
 		 1065 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  30.77 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  31.01 
 
 		 1011 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  33.21 
 
 		 640 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  32.59 
 
 		 657 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  31.75 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  28.62 
 
 		 1157 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  27.84 
 
 		 766 aa  88.2  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  29.24 
 
 		 1224 aa  83.2  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  28.73 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  27.41 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  26.99 
 
 		 679 aa  74.7  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  26.5 
 
 		 979 aa  68.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  29.05 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  34.39 
 
 		 904 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  24.43 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  21.04 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  21.61 
 
 		 522 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  22.57 
 
 		 431 aa  52  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4292  hypothetical protein  30.85 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927933  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  24.32 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  28.57 
 
 		 406 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3993  hypothetical protein  26.44 
 
 		 872 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>