20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0421 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  26.99 
 
 
641 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  26.3 
 
 
979 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  25.67 
 
 
766 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  26.37 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  25.24 
 
 
914 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  25.15 
 
 
1065 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  25.87 
 
 
1011 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  23.76 
 
 
657 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  27.59 
 
 
1157 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  31.03 
 
 
630 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  27.05 
 
 
640 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  35.44 
 
 
429 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  25 
 
 
359 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  27.62 
 
 
623 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  23.6 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  25.89 
 
 
748 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  24.32 
 
 
624 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.49 
 
 
1224 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  30.33 
 
 
522 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>