18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1476 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1374    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  29.18 
 
 		 640 aa  187  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  27.32 
 
 		 630 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  27.5 
 
 		 623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  29.59 
 
 		 359 aa  120  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  28.26 
 
 		 641 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  26.46 
 
 		 802 aa  89.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  29.88 
 
 		 766 aa  80.9  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  29.27 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  28.76 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  30.43 
 
 		 624 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  27.35 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  25.79 
 
 		 1157 aa  58.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  24.55 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  24.19 
 
 		 914 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  24.19 
 
 		 1065 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  22.64 
 
 		 1011 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  24.47 
 
 		 979 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>