27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2035 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  100 
 
 
1157 aa  2375    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  26.74 
 
 
1065 aa  202  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  26.91 
 
 
914 aa  201  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  28.18 
 
 
1011 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  31.62 
 
 
766 aa  154  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  28.48 
 
 
641 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  28.12 
 
 
657 aa  146  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2037  hypothetical protein  45.19 
 
 
142 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  28.67 
 
 
488 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  30.16 
 
 
1224 aa  115  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  25 
 
 
979 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  25.74 
 
 
429 aa  108  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  24.75 
 
 
748 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  26.04 
 
 
640 aa  97.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  27.86 
 
 
802 aa  89  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  24.33 
 
 
522 aa  87  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  25.86 
 
 
431 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  25.88 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  27.55 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  24.09 
 
 
522 aa  82.4  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  25.44 
 
 
623 aa  80.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  26.03 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  26.45 
 
 
630 aa  77  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2808  alpha-clostripain-like protein  23.02 
 
 
406 aa  67  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  27.59 
 
 
310 aa  63.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  25.79 
 
 
679 aa  58.5  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  25.36 
 
 
904 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>