16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0720 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0720  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  701    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  24.11 
 
 
686 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1467  hypothetical protein  44.71 
 
 
739 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  26.18 
 
 
645 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  26.54 
 
 
591 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  23.5 
 
 
902 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  24.19 
 
 
510 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.68 
 
 
1043 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  30.97 
 
 
610 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  22.97 
 
 
777 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  34.57 
 
 
523 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  23.4 
 
 
622 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  40.58 
 
 
523 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.06 
 
 
609 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.8 
 
 
623 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  23.49 
 
 
1097 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>