76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4324 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  37.82 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  35.96 
 
 
224 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  35.96 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  35.96 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  35.2 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  35.39 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  35.22 
 
 
349 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  30.9 
 
 
357 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  30.46 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  28.31 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  28.64 
 
 
315 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  29.8 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  29.14 
 
 
380 aa  78.2  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  28.74 
 
 
343 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  29.19 
 
 
338 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  29.55 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  29.84 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  29.19 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  27.01 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  28.74 
 
 
316 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  30.34 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  26.97 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  25.77 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  29.19 
 
 
338 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  29.19 
 
 
338 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  28.48 
 
 
315 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  28.65 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  28.11 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  28.65 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25.47 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.59 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  27.59 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.59 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  27.63 
 
 
925 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  25.28 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  29.03 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  24.4 
 
 
364 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
159 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  26.9 
 
 
337 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  26.67 
 
 
337 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  24.88 
 
 
443 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  25.74 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  24.14 
 
 
316 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  24.37 
 
 
328 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  25.25 
 
 
337 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  24.75 
 
 
337 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  23.76 
 
 
813 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  22.54 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  25.87 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  31.55 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
161 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  30.61 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  23.7 
 
 
357 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  25.2 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  27.89 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  24.28 
 
 
354 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  22.41 
 
 
443 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  24.34 
 
 
341 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  28.98 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 
818 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  22.52 
 
 
810 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  24.86 
 
 
338 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  29.87 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  32.41 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.27 
 
 
842 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  25 
 
 
819 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  31.25 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  26.23 
 
 
447 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0811  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3994  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
175 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  25.85 
 
 
187 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  30.09 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>