27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3523 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3523  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1567  hypothetical protein  44.53 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2005  DoxX family protein  45.24 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4336  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1511  hypothetical protein  44.09 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4148  hypothetical protein  40.5 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2193  DoxX family protein  41.73 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2652  DoxX family protein  46.67 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0416  DoxX family protein  42.4 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11930  DoxX protein  43.44 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1667  DoxX family protein  40.5 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000553116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2609  hypothetical protein  42.98 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.32019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3024  DoxX family protein  40.48 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3959  DoxX family protein  39.02 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2375  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0247  DoxX family protein  42.42 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4749  DoxX family protein  39 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2310  hypothetical protein  34.75 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.189779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18060  DoxX protein  40.16 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0915  hypothetical protein  40.65 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.561227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3735  hypothetical protein  37.21 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5995  DoxX family protein  34.68 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.158002  normal  0.0523369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0608  DoxX family protein  39.6 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2759  hypothetical protein  26.4 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1690  DoxX family protein  34.96 
 
 		 134 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5906  hypothetical protein  26.23 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4595  hypothetical protein  31.67 
 
 		 126 aa  40  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.901907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>