More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1246 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  56.79 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  62.38 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  47.83 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  47.81 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  47.27 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  44.8 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  39.71 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  44.86 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  44.3 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  43.8 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  44.8 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  48.52 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  44.09 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  42.56 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  44.09 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  44.09 
 
 		 254 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  42.15 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  45.21 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  42.15 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  44.69 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  40.84 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  42.67 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  41.59 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  41.59 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  42.74 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  42.74 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  42.15 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  43.81 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  41.8 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  38.69 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  41.7 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  38.69 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  39.69 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  42.53 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  42.53 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  42.53 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  39.2 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  39.91 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  39.6 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  39.47 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  43.53 
 
 		 269 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  39.47 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  39.47 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  39.47 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  44.8 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  40.45 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  35.55 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  43.31 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  35.83 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  38.74 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  43.38 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  41.26 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  44.44 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  36.75 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.84 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  30.2 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.3 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  32.93 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.08 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  32.73 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  35.29 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  35.29 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.04 
 
 		 261 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  33.18 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  32.89 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  35.2 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  29.39 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  34.63 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  42.86 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.71 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  31.13 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  34.11 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.88 
 
 		 251 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  32.82 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  30.23 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  30.4 
 
 		 376 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  31.44 
 
 		 384 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  31.53 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.16 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  32.1 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  32.66 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  32.24 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  32.46 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  32.46 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.51 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  31.41 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  30.95 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  35.64 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  33.86 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  29.22 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>