123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0296 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0296  bifunctional sirohydrochlorin cobalt chelatase/precorrin-8X methylmutase  100 
 
 
310 aa  607  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1526  bifunctional sirohydrochlorin cobalt chelatase/precorrin-8X methylmutase  55.06 
 
 
323 aa  305  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.36 
 
 
332 aa  212  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.16 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  30.26 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  31.82 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.53 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  28.5 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  27.5 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3214  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  28.22 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0513  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  32.93 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1858  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.49 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.240156 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  23.83 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  27.32 
 
 
212 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3460  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.88 
 
 
238 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  30.81 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  30.69 
 
 
214 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  27.92 
 
 
205 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  33.67 
 
 
210 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1225  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  30.49 
 
 
221 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547545  normal  0.86502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1718  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  28.66 
 
 
217 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  27.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  25.91 
 
 
212 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  31.16 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  27.08 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1081  precorrin-8X methylmutase  28.66 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.17 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  33.89 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  27.64 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  29.17 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  29.52 
 
 
249 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  25.84 
 
 
212 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  25.84 
 
 
210 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.46 
 
 
472 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  29.65 
 
 
224 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1004  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  30.14 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0143  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  28.34 
 
 
209 aa  59.3  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  34.91 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  26.15 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  29.59 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  29.59 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0939  Precorrin-8X methylmutase  32.45 
 
 
206 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  29.07 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  27.37 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  28.64 
 
 
209 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.56 
 
 
214 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.27 
 
 
216 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 
210 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  24.84 
 
 
211 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  28.96 
 
 
210 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  31.54 
 
 
468 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  25.13 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 
210 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  31.53 
 
 
208 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.25 
 
 
469 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  33.33 
 
 
210 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  30.29 
 
 
230 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  30.34 
 
 
221 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  29.59 
 
 
210 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  24.47 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  25 
 
 
200 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.62 
 
 
213 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  32.28 
 
 
218 aa  53.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.67 
 
 
127 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  28.64 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  23.86 
 
 
227 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.6 
 
 
125 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  28.43 
 
 
213 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  29.59 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  31.36 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  28.49 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18361  putative precorrin-8X methylmutase CobH  25.53 
 
 
207 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.644911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  32.56 
 
 
203 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00841  putative precorrin-8X methylmutase CobH  25.25 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  25.63 
 
 
210 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  30.99 
 
 
211 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  29.95 
 
 
534 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18361  putative precorrin-8X methylmutase CobH  23.31 
 
 
207 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  23.12 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  27.91 
 
 
208 aa  49.3  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  27.11 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  32.47 
 
 
512 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.78 
 
 
133 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  29.53 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  29.53 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  29.53 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  26.11 
 
 
520 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  28.25 
 
 
221 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.19 
 
 
122 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  29.52 
 
 
209 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  33.51 
 
 
199 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  27.06 
 
 
217 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.72 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  26.74 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  26.74 
 
 
208 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  29.38 
 
 
208 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  25.98 
 
 
213 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  28.5 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  28.5 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  31.25 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>