43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1700 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  62.65 
 
 
89 aa  120  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  52.81 
 
 
91 aa  104  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  47.78 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  41.18 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  36.14 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.22 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  34.29 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  34.29 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  34.29 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  30.59 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  33.71 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  28.09 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  34.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  34.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  34.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  34.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  28.09 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  25 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  29.41 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  31.08 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  32.88 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  32.88 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  32.88 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  25.56 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3546  hypothetical protein  29.27 
 
 
117 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  26.44 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  30.56 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  31.75 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.67 
 
 
406 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  34.33 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  25.84 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
136 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  28.12 
 
 
141 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  27.38 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  30.14 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  23.75 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  31.82 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  34.48 
 
 
107 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.34 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  34.48 
 
 
109 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>