53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1645 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  62.65 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  55.42 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  47.06 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  47.76 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  37.65 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.83 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  36.47 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  31.11 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  31.11 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  35.14 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  32.94 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  32.94 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  32.94 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  32.94 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.26 
 
 		 406 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  30.49 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  32.93 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1847  putative thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000930987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  30.49 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  27.63 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  34.29 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  27.63 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  27.06 
 
 		 286 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  35.53 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.97 
 
 		 287 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  29.27 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  35.53 
 
 		 460 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  23.08 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1508  thioredoxin, putative  29.63 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  28.57 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  30.26 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  20.73 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1984  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  26.83 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  37.93 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  29.33 
 
 		 285 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  30.49 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  30.34 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  30.49 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  26.25 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0636  thioredoxin domain-containing protein  27.94 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  28.4 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0920  putative thioredoxin  24.69 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2360  thioredoxin domain-containing protein  31.75 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177499  hitchhiker  0.00135525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>