More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0597 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  45.58 
 
 		 812 aa  702    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  56.96 
 
 		 791 aa  893    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0597  ATPase  100 
 
 		 733 aa  1459    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.139339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  46.1 
 
 		 789 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  43.17 
 
 		 869 aa  648    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  44.93 
 
 		 822 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  46.17 
 
 		 820 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  44.94 
 
 		 821 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  45.25 
 
 		 823 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  44.44 
 
 		 814 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0023  ATPase AAA-2 domain protein  46.23 
 
 		 789 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  44.93 
 
 		 826 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.46 
 
 		 815 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  42.96 
 
 		 814 aa  668    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  45.02 
 
 		 824 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  44.33 
 
 		 812 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  42.56 
 
 		 815 aa  649    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  45.1 
 
 		 825 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  46.46 
 
 		 812 aa  701    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  46.17 
 
 		 820 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0310  ATPase  65.41 
 
 		 741 aa  1003    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  45.56 
 
 		 812 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  53.06 
 
 		 789 aa  774    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  44.54 
 
 		 886 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  43.66 
 
 		 824 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  45.05 
 
 		 822 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  45.25 
 
 		 825 aa  666    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  44.7 
 
 		 816 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  53.99 
 
 		 792 aa  738    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 828 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  44.33 
 
 		 824 aa  662    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  45.02 
 
 		 812 aa  696    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  45.96 
 
 		 792 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  43.6 
 
 		 810 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  43.34 
 
 		 842 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  42.65 
 
 		 858 aa  635  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.66 
 
 		 836 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.66 
 
 		 844 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  43.88 
 
 		 814 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  43.66 
 
 		 844 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  43.05 
 
 		 830 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  42.35 
 
 		 830 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  42.48 
 
 		 852 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  42.32 
 
 		 825 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  42.63 
 
 		 842 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  42.47 
 
 		 837 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 851 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  41.26 
 
 		 854 aa  623  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  42.8 
 
 		 830 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  45.16 
 
 		 830 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  42.13 
 
 		 854 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  42.47 
 
 		 841 aa  623  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  41.5 
 
 		 823 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  41.92 
 
 		 855 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  42.56 
 
 		 840 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  43.4 
 
 		 813 aa  622  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  42.38 
 
 		 818 aa  622  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  42.38 
 
 		 818 aa  622  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  43.3 
 
 		 822 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  42.63 
 
 		 848 aa  621  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  42.09 
 
 		 932 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  42.35 
 
 		 836 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  42.1 
 
 		 839 aa  620  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  43.73 
 
 		 841 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  42.68 
 
 		 834 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  42.24 
 
 		 847 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6630  ATPase AAA-2 domain protein  41.98 
 
 		 844 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  42.68 
 
 		 834 aa  618  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  43.65 
 
 		 894 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  41.78 
 
 		 850 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.56 
 
 		 851 aa  618  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  42.04 
 
 		 847 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  43.89 
 
 		 810 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  44.05 
 
 		 830 aa  615  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  42.7 
 
 		 861 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  42.38 
 
 		 834 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  42.5 
 
 		 837 aa  610  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  41.75 
 
 		 842 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  42.97 
 
 		 944 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  41.85 
 
 		 846 aa  608  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  42.29 
 
 		 850 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  43.14 
 
 		 814 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  41.2 
 
 		 852 aa  608  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4466  ATPase  42.03 
 
 		 964 aa  608  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.93 
 
 		 866 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  42.07 
 
 		 940 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  42.84 
 
 		 942 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  42.24 
 
 		 852 aa  605  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  42.73 
 
 		 847 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  43.02 
 
 		 814 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  42.73 
 
 		 847 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3836  ATPase AAA-2 domain-containing protein  43.11 
 
 		 825 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  41.41 
 
 		 949 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 824 aa  599  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  42.2 
 
 		 851 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.87 
 
 		 858 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  41.97 
 
 		 848 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  41.92 
 
 		 847 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  41.99 
 
 		 949 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  41.63 
 
 		 843 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>