52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2669 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  100 
 
 		 176 aa  333  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  57.24 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  38.93 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  37.14 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  39.62 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  36.88 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  37.11 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  36.89 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  34.34 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.37 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  31.1 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  31.29 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01530  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  38.05 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1587  hypothetical protein  33.59 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  33.33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  40.51 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.48 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  32.65 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  28.38 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  28.68 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.51 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.4 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.9 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.95 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  30.11 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  34.78 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.24 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  29.57 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19560  sodium hydrogen antiporter subunitE, ShaE  37.93 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0245623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  27.91 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.46 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.09 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  31.65 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.62 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  29.82 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  29.87 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.82 
 
 		 174 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_002978  WD0765  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  19.88 
 
 		 176 aa  42  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.922153  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  29.41 
 
 		 344 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.63 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.63 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.48 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  27.5 
 
 		 172 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.55 
 
 		 159 aa  42  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 		 156 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.38 
 
 		 157 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  29.22 
 
 		 349 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.35 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  31.4 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>